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课程负责人
 基本信息
 教学情况
 学术研究
基本信息
姓 名 曹赞霞
性  别 女  
出生年月 1982.09  
最终学历 研究生  
学 位 博士研究生  
职 称 副教授  
职 务 教研室副主任  
所在系部 生物物理重点实验室  
联系电话 0534-8985879  
传 真  
E-mail qiayilai@mail.ustc.edu.cn  
通信地址 山东省德州市大学西路德州学院物理系  
研究方向 生物大分子计算机模拟  


※教学情况

    曹赞霞,副教授,毕业于中国科学技术大学,获生物物理学博士学位。一直主讲生物化学、分子生物学、生物大分子计算机模拟等课程,注重学生学习方法和思维方式的培养;现从事生物物理领域的研究工作,任山东省功能大分子生物物理重点实验室副主任,山东省高校生物物理重点实验室副主任,山东省生物物理重点学科方向负责人,校级精品课程《生物化学》负责人,指导学生毕业论文获山东省优秀学士学位论文并发表在《生物物理学报》上。


(一)近五年来讲授的主要课程

课程名称

课程类别

周学

届数及学生总

人数

生物化学

专业基础课

4

4届,202人

生物化学专题

选修课

2

4届,111人

分子生物学

专业基础课

3

4届,118人

生物大分子计

算机模拟

硕士生专业课

2

2届,4人

专业英语

硕士生专业基

础课

2

2届,4人

(二)近五年承担的实践性教学

实践教学内容

届数及学生总人数

毕业实习

3届,32人

C语言上机

1届,60人

毕业论文

3届,22人

其中1名本科学生的毕业论文于2011年获得山东省优秀学士学位论文,该名学生在《生物物理学报》发表论文。

曹赞霞,张红梅,赵岩,王吉华,固有无序蛋白无序与有序接点处的氨基酸序列分析,生物物理学报. 2011, 27(9):801-811.

(三)近五年来获得的教学表彰/奖励

奖项名称

授予单位

时间

山东省优秀学士学位论文指导教

山东省教育厅

2011

 

 

 
 
※学术研究


    一直致力于人类疾病相关蛋白及其复合物在不同分子力场以及不同模拟环境下的结构与功能特性研究。目前,主持国家自然科学基金课题1项(38万元),联合承担国家自然科学基金及山东省自然科学基金6项。近几年,在国内外重要刊物Journal of Computational Chemistry, Journal of Chemical Physics,  Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, Progress in Biochemistry and Biophysics, Current Computer-Aided Drug Design, BMC Bioinformatics, International Journal of Molecular Science, 生物物理学报等发表论文20篇。研究成果受到国内外同行的关注,应邀在第八届国际生物信息学研讨会(2010年6月)上做专题报告,获德州学院优秀科研成果二等奖(第一位),德州学院科研突出成就奖。

(一)近五年来承担的学术研究课题

    (1) 国家自然科学基金项目《基于分子模拟方法研究环境因素和相互作用蛋白如何调节α-synuclein蛋白的异常聚集》(31000324)(第一位),2011-2013;

    (2) 国家自然科学基金项目《疾病相关固有无序蛋白α-synuclein和P53结构与功能特性的计算机模拟研究》(30970561)(第三位),2010-2012;

    (3) 山东省自然科学基金课题《淀粉样蛋白质结构与功能特性的计算机模拟和网络研究》(2009ZRA14028)(第四位),2010-2012;

    (4) 山东省自然科学基金课题《肿瘤抑制蛋白p53及其复合物结构与功能特性的计算机模拟研究》(2009ZRA14027)(第五位),2010-2012;

    (5) 山东省自然科学基金课题《基于复杂网络方法的固有无序蛋白结构特征研究》(ZR2010CQ033)(第二位),2011-2013。

 

(二)近五年来在SCI期刊发表论文近20篇,代表性论文:

    1. Cao Zanxia, Lin Zhixiong, Wang Jun, Liu Haiyan,Refining the description of peptide backbone conformations improves protein simulations using the GROMOS 53A6 force field,J Comput Chem, 2009, 30: 645–660.

    2.  Cao Zanxia and Liu Haiyan, Using free energy perturbation to predict effects of changing force field parameters on computed conformational equilibriums of peptides, J. Chem. Phys. 2008, 129: 015101.

    3.  Cao Zanxia, Wang Jihua, A comparative study of two different force fields on structural and thermodynamics character of H1 peptide via molecular dynamics simulations, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2010, 27(5):651-662

    4.  Cao Zanxia, Wang Jihua, A comparative study of different temperatures on computed structural character of H1 peptide via temperature replica exchange molecular dynamics simulations, Progress in Biochemistry and Biophysics. 2010, 37(3):319-325

    5.  Cao Zanxia, Lei Liu, Wang Jihua, Effects of pH and temperature on the structural and thermodynamic character of α-syn12 peptide in aqueous solution, Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 2010, 28:343-353

    6. 曹赞霞,王吉华,促进或抑制α-synuclein蛋白异常聚集的相互作用蛋白,生物物理学报. 2010, 26:783-789.

    7.  Cao Zanxia, Lei Liu, Ping Wu, Wang Jihua, Structural and thermodynamics characters of isolated α-syn12 peptide: long time T-REMD in aqueous solution, Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2011, 43(3):172-80.

    8.  Cao Zanxia, Lei Liu, Wang Jihua, Why the OPLS-AA force field cannot produce the β-hairpin structure of H1 peptide in solution when comparing with the GROMOS 43A1 force field? Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2011, 29(3)

    9. 曹赞霞,张红梅,赵岩,王吉华,固有无序蛋白无序与有序接点处的氨基酸序列分析,生物物理学报. 2011, 27(9):801-811.

    10.  Li Xiang, Zhang Jiahai, Cao Zanxia, Wu Jihui and Shi Yunyu,Solution structure of GOPC PDZ domain and its interaction with the C-terminal motif of neuroligin, Protein Sci. 2006, 15: 2149-2158.

    11. Zhao Liling, Wang Jihua, Dou Xianghua, Cao Zanxia, Studying the unfolding process of protein G and protein L under physical property space, BMC Bioinformatics. 2009, 10(Suppl 1): S44.

    12. Li Quan, Cao Zanxia, Liu Haiyan, Improve the Prediction of RNA-binding residues using Structural Neighbours, Protein & Peptides Letters. 2010, 17(3):287-296

    13. Wang Jihua, Cao Zanxia, Li Shuqiang, Molecular dynamics simulations of intrinsically disordered proteins in human diseases, Current Computer-Aided Drug Design. 2009, 5:280-287

    14. Wang Jihua, Cao Zanxia, Yu Jiafeng, Protein Structures-based Neighborhood Analysis vs Preferential Interactions Between the Special Pairs of Amino acids? Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 2011, 28(4):629-632.

    15. Wang Jihua, Cao Zanxia, Liling Zhao, Shuqiang Li, Novel Strategies for Drug Discovery Based on Intrinsically Disordered Proteins (IDPs), Int. J. Mol. Sci. 2011, 12:3205-3219.

 

(三)近五年来获得的学术研究表彰/奖励
    1. 《计算机模拟方法研究构象病相关蛋白大尺度构象转变》,德州学院优秀科研成果奖,(第一位), 2011
    2.  德州学院学术骨干,2011
    3.  德州学院科研突出成就奖

 
 
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